COVID-19 : les écouvillonnages nasaux ou de gorge sont tous deux efficaces pour détecter le variant Omicron du SARS-CoV-2

  • Patriquin G & al
  • medRxiv

  • Univadis
  • Clinical Summary
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À retenir

  • Les écouvillonnages nasopharyngés (NP) et l’association des écouvillonnages oropharyngés/nasaux (OPN) ont une sensibilité similaire pour la détection du variant Omicron du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) par test d’amplification des acides nucléiques.

Pourquoi est-ce important ?

  • Malgré l’altération du tropisme tissulaire associé au variant Omicron, le prélèvement par écouvillonnage NP ou OPN permet une détection moléculaire suffisante du SARS-CoV-2.

Principaux résultats

  • 392 participants disposant d’échantillons NP/OPN appariés.
  • Le taux de positivité global était de 16,3 % ; 328 participants dont les échantillons NP/OPN étaient négatifs, 56 participants dont les échantillons étaient positifs et 8 participants dont les résultats étaient contradictoires (1 participant dont l’échantillon NP seul était positif et 7 participants dont l’échantillon OPN seul était positif).
  • Sensibilité : échantillons NP (89,1 % ; intervalle de confiance [IC] à 95 % : 78,8–94,9 %), par rapport aux échantillons OPN (100 % ; IC à 95 % : 92,5–100 %).
  • Spécificité : échantillons NP (98,4 % ; IC à 95 % : 90,0 % à plus de 99,9 %), par rapport aux échantillons OPN (100 % ; IC à 95 % : 93,1–100 %) ; P = 0,052.

Méthodologie

  • Une comparaison populationnelle et prospective dans une approche d’amélioration de la qualité a porté sur les écouvillonnages NP, par rapport aux écouvillonnages OPN combinés, pour la détection du variant préoccupant Omicron du SARS-CoV-2.
  • Financement : aucun financement n’a été communiqué.

Limites

  • Données de prépublication.
  • Les informations cliniques (symptomatologie, moment des prélèvements par écouvillonnage, comorbidités, statut d’immunisation) étaient insuffisantes.
  • La qualité des prélèvements n’a pas été évaluée.