COVID-19 : les écouvillonnages nasaux ou de gorge sont tous deux efficaces pour détecter le variant Omicron du SARS-CoV-2

À retenir

Les écouvillonnages nasopharyngés (NP) et l’association des écouvillonnages oropharyngés/nasaux (OPN) ont une sensibilité similaire pour la détection du variant Omicron du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) par test d’amplification des acides nucléiques.

Pourquoi est-ce important ?

Malgré l’altération du tropisme tissulaire associé au variant Omicron, le prélèvement par écouvillonnage NP ou OPN permet une détection moléculaire suffisante du SARS-CoV-2.

Principaux résultats

392 participants disposant d’échantillons NP/OPN appariés.
Le taux de positivité global était de 16,3 % ; 328 participants dont les échantillons NP/OPN étaient négatifs, 56 participants dont les échantillons étaient positifs et 8 participants dont les résultats étaient contradictoires (1 participant dont l’échantillon NP seul était positif et 7 participants dont l’échantillon OPN seul était positif).
Sensibilité : échantillons NP (89,1 % ; intervalle de confiance [IC] à 95 % : 78,8–94,9 %), par rapport aux échantillons OPN (100 % ; IC à 95 % : 92,5–100 %).
Spécificité : échantillons NP (98,4 % ; IC à 95 % : 90,0 % à plus de 99,9 %), par rapport aux échantillons OPN (100 % ; IC à 95 % : 93,1–100 %) ; P = 0,052.

Méthodologie

Une comparaison populationnelle et prospective dans une approche d’amélioration de la qualité a porté sur les écouvillonnages NP, par rapport aux écouvillonnages OPN combinés, pour la détection du variant préoccupant Omicron du SARS-CoV-2.
Financement : aucun financement n’a été communiqué.

Limites

Données de prépublication.
Les informations cliniques (symptomatologie, moment des prélèvements par écouvillonnage, comorbidités, statut d’immunisation) étaient insuffisantes.
La qualité des prélèvements n’a pas été évaluée.

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