COVID-19 : le test PCR salivaire montre une faible sensibilité pour détecter l’infection asymptomatique
- Congrave-Wilson Z & al.
- JAMA
- Univadis
- Clinical Summary
À retenir
- Le test d’amplification en chaîne par polymérase (Polymerase Chain Reaction, PCR) salivaire présente une faible sensibilité pour détecter l’infection asymptomatique au SARS-CoV-2.
Pourquoi est-ce important ?
- Bien que le dépistage du SARS-CoV-2 se basant sur la salive soit considéré comme une alternative raisonnable aux écouvillons nasopharyngés, il se pourrait qu’il ne fournisse pas de résultats aussi précis dans les cas d’infections asymptomatiques, ce qui limite son utilité globale pour le dépistage.
Principaux résultats
- 889 échantillons de salive et échantillons par écouvillonnage nasopharyngé provenant de 404 participants ont été appariés.
- Échantillons positifs : 58,9 % des échantillons nasopharyngés et 35,7 % des échantillons de salive.
- Détection du SARS-CoV-2 dans les deux échantillons : 29,0 %.
- Les participants ont eu en médiane 3 visites (intervalle interquartile : 2–4).
- 36,3 % des patients ont été asymptomatiques tout au long de l’infection.
- 77,3 % des patients symptomatiques ont présenté une forme légère de la maladie.
- Sensibilité du test salivaire, semaine 1 : 71,2 % (intervalle de confiance [IC] à 95 % : 62,6 %–78,8 %).
- Parmi les patients symptomatiques : 88,2 %.
- Parmi les patients asymptomatiques : 58,2 % (P < 0,001).
- Sensibilité du test salivaire, semaine 2 : 83,0 % chez les patients symptomatiques contre 52,6 % chez les patients asymptomatiques (P < 0,001).
- Pour chaque jour écoulé après l’apparition de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), le rapport de cotes (RC) pour la détection salivaire était de 0,94 par rapport au jour précédent (P < 0,001).
- Les patients symptomatiques au moment du recueil/prélèvement des échantillons ou présentant des charges virales nasopharyngées élevées étaient plus susceptibles d’avoir un échantillon salivaire positif que les patients asymptomatiques ou présentant des charges virales nasopharyngées faibles :
- Patients symptomatiques par rapport à patients asymptomatiques : RC de 2,8 (P < 0,001).
- Charges virales élevées par rapport à non élevées : RC de 5,2 (P < 0,001).
Méthodologie
- Étude longitudinale prospective évaluant l’intervalle de réalisation du test pour le dépistage optimal du SARS-CoV-2 par PCR après transcription inverse.
- Financement : Instituts nationaux américains de la santé (National Institutes of Health, NIH.
Limites
- Probabilité de la maladie préalablement au test élevée (les échantillons ont été recueillis/prélevés après exposition des participants au sein de leur foyer).
- Le test de référence (écouvillonnage nasopharyngé) perd de sa sensibilité plus de 10 jours après l’infection.
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