COVID-19 : la sous-lignée BA.2 d’Omicron ne se traduit pas par une plus grande sévérité clinique que BA.1

Pourquoi est-ce important ?

• La sous-lignée BA.2 est de plus en plus présente dans le monde ; sa sévérité clinique est inconnue.

Méthodologie

• Une cohorte rétrospective (n = 680 555 infections par le SARS-CoV-2) a utilisé des couplages de données à partir de données nationales de cas de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), de données sur les tests de laboratoire du SARS-CoV-2 et des hospitalisations nationales pour cause de COVID-19.
• En utilisant le kit d’amplification en chaîne par polymérase (Polymerase Chain Reaction, PCR) TaqPath COVID-19 (n = 95 470), les infections avec résultat positif pour le gène S (absence de délétion 69–70) étaient un indicateur de sous-lignée BA.2 ; les infections avec négativation de la détection du gène S (présence d’une délétion 69–70) étaient un indicateur de sous-lignée BA.1.
• La maladie grave a été définie par une admission en unité de soins intensifs (USI), l’administration d’une oxygénothérapie, la mise sous ventilation, l’administration d’une oxygénation par membrane extracorporelle, la présentation d’un syndrome de détresse respiratoire aiguë et/ou le décès.
• Financement : Conseil sud-africain de la recherche médicale (South African Medical Research Council) et fonds du département national de la Santé (National Department of Health).

Principaux résultats

• BA.2 avait un avantage compétitif sur BA.1, car la proportion d’infections avec résultat positif pour le gène S a augmenté de 3 % à 80 % au niveau national, du 1er décembre 2021 au 29 janvier 2022.
• Aucune différence n’a été constatée entre BA.1 et BA.2 concernant les hospitalisations (rapport de cotes corrigé [RCc] : 0,96 ; intervalle de confiance [IC] à 95 % : 0,85–1,09) et la sévérité de la maladie (RCc : 0,91 ; IC à 95 % : 0,68–1,22).

Limites

• Les échantillons se sont limités à ceux testés par le kit PCR TaqPath COVID-19.