2020, une année record pour les principales maladies infectieuses

  • Launay T & al.
  • PLoS One

  • Caroline Guignot
  • Résumé d’article
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Une baisse de 90% des cas de varicelle au cours du premier confinement de 2020, et de plus de la moitié sur toute l’année 2020, ou encore une réduction large et durable des diarrhées aiguës principalement chez les enfants… Avec les gestes barrière, les confinements et la distanciation physique imposés par la pandémie de COVID-19, les médecins généralistes ont constaté l’évolution à la baisse des consultations pour différentes pathologies infectieuses habituellement fréquentes. Mais comment les chiffres ont-ils évolué, notamment à l’issue du confinement et au cours de la période automnale et hivernale, propices à leur majoration ? Pour le savoir, une équipe parisienne a conduit une analyse des chiffres annuels issus de la surveillance nationale existant en soins primaires entre 2016 et 2020 : Sentinelles pour la diarrhée aiguë et la varicelle, base de données EMR IQVIA de 1.200 généralistes pour la bronchiolite. Pour ces différentes maladies infectieuses, ils ont parallèlement intégré les données IQVIA de 14.000 pharmacies concernant les médicaments OTC (anti-émtiques et antinauséeux, antidiarrhéiques…) et les volumes de requêtes enregistrées sur le web par Google Trends.

Chute des chiffres au printemps 2020, reprise à bas bruit en fin d’année

Les trois types de données analysées ont confirmé une chute de la fréquence des diarrhées aiguës en 2020, de près de 67% par rapport aux années précédentes. Cette chute a été particulièrement impressionnante entre le début et la fin du premier mois de confinement de 2020, avec une incidence basculant de 94 à 25 cas pour 100.000 habitants. La réduction des chiffres attendus était d’environ un tiers avant le deuxième confinement. Le nombre de cas a ensuite réaugmenté, mais de façon modérée, sur la période automnale et hivernale, principalement chez les plus jeunes patients. Il existait une corrélation entre les chiffres d’incidence du COVID-19 et ceux de la diarrhée aiguë au niveau régional.

La saisonnalité de la varicelle s’est maintenue au cours de 2020, mais les cas ont quasiment disparu au cours du premier confinement, la baisse ayant été de 50 à 90% selon les régions. Ils sont restés rares au cours des mois suivants pour reprendre de façon moins élevée qu’habituellement sur le dernier trimestre 2020 (-18%).

La bronchiolite a connu pour sa part une baisse drastique au cours de l’année, et particulièrement importante au cours des deux confinements, avec une incidence réduite de 79 et 78% respectivement. De même, les consultations pour infection respiratoire aiguë ont connu les mêmes évolutions avec 49 et 55% de baisse au cours des deux confinements. Il est intéressant de souligner que les prélèvements réalisés par le réseau Sentinelles ont rapporté que ces infections étaient liées à d’autres virus que ceux habituellement rapportés au cours des années précédentes, avec notamment une faible circulation des deux principaux agents de 2019 (influenza et VRS).